27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1700 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
430 aa  858    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  71.93 
 
 
431 aa  610  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  72.51 
 
 
431 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  43.59 
 
 
437 aa  316  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  43.33 
 
 
432 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  39.59 
 
 
437 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  40.25 
 
 
428 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  39 
 
 
450 aa  290  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  41.96 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  37.47 
 
 
467 aa  279  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  37.11 
 
 
449 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  26.3 
 
 
642 aa  86.7  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  25.2 
 
 
637 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  29.29 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  36.94 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  24.13 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  23.21 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  32.24 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  35.29 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  28.95 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  28.95 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  24.79 
 
 
569 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  23.53 
 
 
533 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  22.6 
 
 
517 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  25.95 
 
 
563 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  24.85 
 
 
429 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1636  hypothetical protein  24.47 
 
 
761 aa  43.1  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.210403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>