37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0221 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  99.52 
 
 		 432 aa  833    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 437 aa  873    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  48.83 
 
 		 449 aa  405  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  49.5 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  46.81 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  42.09 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  42.28 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  44.13 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  44.34 
 
 		 431 aa  328  8e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  44.18 
 
 		 431 aa  328  9e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  43.07 
 
 		 430 aa  316  6e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  38.99 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  27.57 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  27.57 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  26.25 
 
 		 637 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  26.32 
 
 		 642 aa  90.5  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  24.77 
 
 		 378 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  23.68 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  26.64 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  23.6 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  27.5 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  23.53 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  25.29 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  21.54 
 
 		 569 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  23.22 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  23.29 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  26.32 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  25.88 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  24.85 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  22.83 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  22.83 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  22.25 
 
 		 521 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  26.09 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  23.72 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  27.72 
 
 		 824 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  25.97 
 
 		 969 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  22.7 
 
 		 533 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>