28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0690 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  100 
 
 
637 aa  1246    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  31.6 
 
 
609 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  31.43 
 
 
533 aa  220  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  33.27 
 
 
569 aa  212  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  33.16 
 
 
642 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  25.24 
 
 
432 aa  97.8  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  28.98 
 
 
428 aa  97.4  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  26.25 
 
 
437 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  24.55 
 
 
467 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  25.18 
 
 
430 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  25.7 
 
 
449 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  24.88 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  23.89 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  25.33 
 
 
437 aa  77  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  24.68 
 
 
436 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  23.95 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  29.86 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  24.15 
 
 
352 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  22.98 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  25.65 
 
 
370 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4247  hypothetical protein  31.51 
 
 
379 aa  60.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  22.05 
 
 
521 aa  57.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  22.62 
 
 
521 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  20.08 
 
 
547 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  21.2 
 
 
824 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  20.44 
 
 
521 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  23.59 
 
 
380 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  27.84 
 
 
373 aa  44.3  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>