22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1195 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1110    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  42.83 
 
 		 533 aa  333  6e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  39.71 
 
 		 642 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  33.96 
 
 		 637 aa  217  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  31.49 
 
 		 609 aa  206  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  24.09 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  25.15 
 
 		 428 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  23.44 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  22.33 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  24.11 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  21.54 
 
 		 437 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  24.48 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  21.54 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  23.24 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  24.43 
 
 		 431 aa  54.3  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  24.43 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  24.88 
 
 		 369 aa  50.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  31.07 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1105  hypothetical protein  24.87 
 
 		 323 aa  47.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.66021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  21.9 
 
 		 380 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 815 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>