15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3171 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 815 aa  1626    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 563 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2627  S-layer domain-like protein  26.08 
 
 		 685 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  24.82 
 
 		 824 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0288  hypothetical protein  29.85 
 
 		 345 aa  118  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0491  hypothetical protein  21.44 
 
 		 857 aa  95.5  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0891  S-layer protein  24.12 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.987001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  20.11 
 
 		 642 aa  63.9  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  25.36 
 
 		 389 aa  54.3  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  27.71 
 
 		 517 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  25.23 
 
 		 425 aa  52.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  24.7 
 
 		 521 aa  52.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 427 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  28.43 
 
 		 569 aa  44.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  20 
 
 		 637 aa  44.3  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>