13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0288 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0288  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  698    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  30.87 
 
 		 563 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 815 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2627  S-layer domain-like protein  27.42 
 
 		 685 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  27.86 
 
 		 824 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0891  S-layer protein  26.32 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.987001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0491  hypothetical protein  25 
 
 		 857 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  25.1 
 
 		 462 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1200  hypothetical protein  24.12 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0464187  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  25.32 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  24.66 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  22.9 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0110  hypothetical protein  23.43 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>