24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0942 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
563 aa  1147    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  30.43 
 
 
815 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2627  S-layer domain-like protein  27.66 
 
 
685 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0491  hypothetical protein  27.66 
 
 
857 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0288  hypothetical protein  33.06 
 
 
345 aa  134  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  22.74 
 
 
824 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0891  S-layer protein  26.03 
 
 
388 aa  92.4  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.987001  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0253  hypothetical protein  28.28 
 
 
409 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0110  hypothetical protein  25.11 
 
 
266 aa  62  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1660  hypothetical protein  28.16 
 
 
410 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0968  hypothetical protein  26.46 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  22.62 
 
 
642 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  23.58 
 
 
431 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  25.6 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  23.88 
 
 
431 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1561  hypothetical protein  26.29 
 
 
412 aa  53.9  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  21.73 
 
 
437 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  25.68 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  22.13 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  21.98 
 
 
521 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  22.55 
 
 
521 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  22.64 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  21.68 
 
 
428 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  20.95 
 
 
425 aa  44.3  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>