43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2198 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 425 aa  848    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  41.4 
 
 		 414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  37.93 
 
 		 427 aa  259  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  34.52 
 
 		 431 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  28.44 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0984  hypothetical protein  28.19 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  20.05 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  28.61 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  27.81 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  31.25 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  24.31 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  24.9 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  24.49 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0891  S-layer protein  24.77 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.987001  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  24.11 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  22.51 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  26.21 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0110  hypothetical protein  23.9 
 
 		 266 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  23.65 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  29.65 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  25.23 
 
 		 815 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  25.11 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  25.41 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  27.05 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 467 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  31.34 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  27.69 
 
 		 459 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  30.3 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  26.38 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  22.55 
 
 		 520 aa  49.7  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  22.55 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  23 
 
 		 521 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  23.03 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  26.03 
 
 		 286 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  28.78 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  21.65 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  23 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  23.41 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  25.24 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  31.4 
 
 		 344 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  23.81 
 
 		 547 aa  43.9  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  21.79 
 
 		 563 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>