35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1061 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 436 aa  873    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  72.56 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  44.92 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  45.14 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  46.93 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  41.13 
 
 		 449 aa  349  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  41.9 
 
 		 467 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  42.61 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  43.93 
 
 		 431 aa  315  9e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  43.93 
 
 		 431 aa  315  9e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  41.8 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  32.6 
 
 		 344 aa  97.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  22.73 
 
 		 642 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  38.46 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  25.32 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  28.26 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  24.62 
 
 		 637 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  28.93 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  23.34 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  27.91 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  21.92 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  32.33 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  22.67 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  30.36 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  24.3 
 
 		 533 aa  57  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  30.38 
 
 		 521 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  29.75 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  24.41 
 
 		 547 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  21.23 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  21.58 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  22.13 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  22.97 
 
 		 969 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  24.51 
 
 		 875 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  22.55 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>