25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2682 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 609 aa  1182    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  31.37 
 
 		 637 aa  229  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  32.27 
 
 		 569 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  33.08 
 
 		 642 aa  197  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  27.3 
 
 		 533 aa  180  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  26.88 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  26.44 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  23.47 
 
 		 437 aa  92  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  26.29 
 
 		 450 aa  91.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  23.58 
 
 		 432 aa  90.9  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  22.2 
 
 		 449 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  24.64 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  35.29 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  23.74 
 
 		 430 aa  77  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  24.03 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  25.62 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  21.37 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  22.04 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  25.25 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  23.76 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  23.76 
 
 		 352 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  21.48 
 
 		 378 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  23.6 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4247  hypothetical protein  33.7 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  23.55 
 
 		 373 aa  50.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>