36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1058 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
450 aa  903    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  73 
 
 
467 aa  649    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  46.45 
 
 
437 aa  385  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  45.99 
 
 
432 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  47.81 
 
 
436 aa  360  4e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  44.25 
 
 
428 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  41.06 
 
 
437 aa  347  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  42.47 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  44.7 
 
 
431 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  44.22 
 
 
431 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  39.8 
 
 
430 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  29.97 
 
 
344 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  39.07 
 
 
354 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  37.75 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  27.32 
 
 
642 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  36.42 
 
 
370 aa  94.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  26.57 
 
 
609 aa  87  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  24.88 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  28.77 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  25.93 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  23.42 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  32.87 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  19.84 
 
 
520 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  19.84 
 
 
520 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  27.51 
 
 
547 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  24.48 
 
 
569 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  23.12 
 
 
521 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  23.08 
 
 
521 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  23.65 
 
 
969 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  22.87 
 
 
521 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  25.18 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  24.63 
 
 
875 aa  50.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  22.92 
 
 
824 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  24.04 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  26.77 
 
 
425 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  22.71 
 
 
533 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>