17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1671 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  759    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  28.14 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  26.4 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  26.8 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  27.38 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  27.94 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  25.66 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  27.8 
 
 		 449 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  22.65 
 
 		 642 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  23.49 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1105  hypothetical protein  26.54 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.66021  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  27.94 
 
 		 637 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  23.62 
 
 		 609 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  26.71 
 
 		 467 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  23.89 
 
 		 450 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  24.73 
 
 		 277 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>