36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0769 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  899    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  48.83 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  48.48 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  46.68 
 
 
428 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  41.07 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  41.87 
 
 
450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  38.44 
 
 
437 aa  333  5e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  41.53 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  39.19 
 
 
431 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  38.3 
 
 
431 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  37.11 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  32.23 
 
 
370 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  28.77 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  22.83 
 
 
642 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  26.86 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  26.54 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  22.62 
 
 
609 aa  79.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  24.77 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  24.1 
 
 
378 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  25 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  24.79 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  23.43 
 
 
569 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1671  hypothetical protein  27.8 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  24.55 
 
 
414 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  25.61 
 
 
547 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  25.41 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  22.56 
 
 
517 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  24.05 
 
 
431 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4247  hypothetical protein  28.95 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  23.68 
 
 
521 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  21.02 
 
 
520 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  20.69 
 
 
520 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  27.92 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  23.45 
 
 
521 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  27.41 
 
 
444 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>