37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1201 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0221  S-layer-like domain-containing protein  99.52 
 
 		 437 aa  833    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1201  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 432 aa  864    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  48.48 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  49.88 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  46.81 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  41.18 
 
 		 467 aa  360  4e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  41.49 
 
 		 437 aa  358  9e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  44.13 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  43.85 
 
 		 431 aa  332  8e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1060  S-layer-like domain-containing protein  43.65 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1700  S-layer-like domain-containing protein  43.33 
 
 		 430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278041  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0866  hypothetical protein  39.1 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1267  hypothetical protein  27.3 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  25.53 
 
 		 642 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0690  hypothetical protein  26.25 
 
 		 637 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3148  hypothetical protein  26.95 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00368646  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2682  conserved repeat domain protein  23.42 
 
 		 609 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2277  hypothetical protein  26.64 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1268  hypothetical protein  24.64 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3149  hypothetical protein  25.27 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196145  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2276  hypothetical protein  26.92 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000426071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  23.45 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  25.5 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  23.22 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  24.8 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1195  hypothetical protein  21.54 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000512165  hitchhiker  0.0000097996 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  26.32 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  25.88 
 
 		 437 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  22.19 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  21.49 
 
 		 521 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  22.19 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  24.7 
 
 		 521 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  26.09 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  23.65 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  27.72 
 
 		 824 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  25.97 
 
 		 969 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0787  hypothetical protein  22.7 
 
 		 533 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>