22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0253 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1660  hypothetical protein  93.4 
 
 
410 aa  763    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0968  hypothetical protein  93.2 
 
 
410 aa  741    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0253  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  825    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1561  hypothetical protein  67.33 
 
 
412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1337  hypothetical protein  46.37 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  37.01 
 
 
547 aa  229  6e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  35.36 
 
 
521 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  35.88 
 
 
521 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  36.1 
 
 
521 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  35.47 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  34.92 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  28.69 
 
 
563 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3011  hypothetical protein  22.73 
 
 
462 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0572791  normal  0.0104514 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  22.12 
 
 
389 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1916  hypothetical protein  32.82 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.654457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  22.61 
 
 
517 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  28.36 
 
 
429 aa  46.6  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  29.01 
 
 
505 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1542  hypothetical protein  30.99 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0171307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0370  hypothetical protein  33.06 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.651873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1085  hypothetical protein  31.97 
 
 
342 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5063  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.71 
 
 
384 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0757957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>