27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0492 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  737    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  60.65 
 
 
380 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  42.63 
 
 
415 aa  272  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  38.6 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  39.95 
 
 
483 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  42.82 
 
 
430 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  34.97 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  34.08 
 
 
422 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  36.53 
 
 
459 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  36.14 
 
 
455 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  33.24 
 
 
391 aa  179  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  29.45 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  32.09 
 
 
463 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  36.78 
 
 
328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  24.2 
 
 
405 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  30.17 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  29.96 
 
 
413 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  28.57 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  26.21 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  29.46 
 
 
505 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  23.92 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  28.23 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  27.23 
 
 
427 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  25 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  26.21 
 
 
425 aa  53.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  23.46 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  21.55 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>