27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1253 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  822    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  45.21 
 
 		 483 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  41.21 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  46.42 
 
 		 430 aa  280  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  42.63 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  35.21 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  38.12 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  38.92 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  34.94 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  33.13 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  31.88 
 
 		 463 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  32.46 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  30.42 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  30.99 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  39.24 
 
 		 328 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  25.91 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  27.88 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  28.9 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  28.04 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  26.98 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  24.71 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  24 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  24.86 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  26.64 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1529  hypothetical protein  26.87 
 
 		 866 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  26.82 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1517  hypothetical protein  27.22 
 
 		 498 aa  43.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>