26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1820 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  868    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  46.54 
 
 
415 aa  280  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  42.98 
 
 
380 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  43.27 
 
 
379 aa  266  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  38.16 
 
 
483 aa  249  9e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  34.57 
 
 
459 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  37.7 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  39.18 
 
 
455 aa  213  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  32.58 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  33.62 
 
 
422 aa  189  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  31.5 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  35.74 
 
 
386 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  30.87 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  33.06 
 
 
405 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 
328 aa  97.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  28.49 
 
 
425 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  24.62 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  28.63 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  28.29 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  23.61 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  26.46 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  27.65 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  26.44 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  26.61 
 
 
505 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  26.89 
 
 
427 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1517  hypothetical protein  24.02 
 
 
498 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>