More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0222 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl177  threonyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 
644 aa  884    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0222  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
639 aa  1307    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
645 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
645 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
645 aa  529  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
652 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
644 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
647 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
643 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
648 aa  498  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
645 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
645 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
645 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
645 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
645 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
645 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
645 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
645 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
645 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
643 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
645 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0626  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
580 aa  492  1e-137  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0662  threonyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
652 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf704  threonyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 
579 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  39.02 
 
 
663 aa  462  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
648 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
646 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1863  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.09 
 
 
601 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
639 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
639 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
645 aa  432  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
647 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
639 aa  429  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
639 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
639 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
639 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
640 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
640 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
639 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
657 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
662 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
640 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
647 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
640 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
641 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 
644 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
646 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 
646 aa  412  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
677 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
636 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 
657 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
643 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
640 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
638 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
643 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
643 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 
659 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
640 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
639 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
596 aa  399  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 
675 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
647 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
633 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 
657 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
635 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
659 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
657 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
648 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
652 aa  389  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
643 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
635 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
636 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
635 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
648 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
652 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
635 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
635 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
635 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
635 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
636 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
635 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
635 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
653 aa  382  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
608 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
638 aa  382  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
635 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
660 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
635 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
649 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
635 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 
641 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
647 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
635 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
635 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
637 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
640 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
660 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
635 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
635 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
645 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>