More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf430 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf430  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
180 aa  243  8e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  240  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  240  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  240  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  240  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  238  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  235  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  235  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  60.12 
 
 
180 aa  231  6e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
180 aa  228  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  60.59 
 
 
179 aa  228  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
180 aa  227  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  227  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  227  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
180 aa  225  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  60 
 
 
179 aa  224  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  56.32 
 
 
180 aa  222  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  59.2 
 
 
183 aa  221  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
181 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  221  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  221  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  221  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  55.75 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  221  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  56.9 
 
 
220 aa  221  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  220  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  220  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  57.47 
 
 
180 aa  219  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  58.29 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  218  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 
180 aa  218  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  58.82 
 
 
179 aa  218  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  218  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  57.31 
 
 
179 aa  218  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  55.75 
 
 
180 aa  217  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  54.02 
 
 
180 aa  217  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  54.02 
 
 
180 aa  217  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  54.02 
 
 
180 aa  217  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  56.47 
 
 
179 aa  216  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 
179 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
180 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  54.05 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  54.39 
 
 
179 aa  214  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  54.55 
 
 
179 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  55.29 
 
 
178 aa  214  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
184 aa  214  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  214  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  55.88 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  55.29 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  57.65 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  55.75 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  55.88 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  54.4 
 
 
193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  56 
 
 
180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  51.12 
 
 
179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
178 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  54.02 
 
 
180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  51.12 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
182 aa  211  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 
179 aa  211  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  54.71 
 
 
179 aa  210  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  55.75 
 
 
186 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  55.75 
 
 
186 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  54.55 
 
 
191 aa  209  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
187 aa  209  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  55.23 
 
 
179 aa  209  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  54.12 
 
 
186 aa  209  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 
189 aa  208  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  50.57 
 
 
193 aa  208  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>