More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf052 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf052  ribosome recycling factor  100 
 
 		 183 aa  362  2e-99  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  39.77 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  40.62 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  34.66 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  37.5 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  34.46 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  35.56 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  36.84 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  33.7 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  35.56 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  35.56 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  36.67 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0978  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  36 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  35.43 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  35.43 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  35.43 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  35.43 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  35.43 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  35.43 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  35.23 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  35.23 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  34.86 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  36.67 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  35.68 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  34.78 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  34.86 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  32.8 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0578  ribosome recycling factor (ribosome releasing factor)  34.78 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  37.43 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  34.83 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  34.83 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  35.33 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  33.15 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  35.68 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  38.6 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  35.09 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  34.5 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  35.09 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  31.52 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  37.04 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  34.24 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_002620  TC0048  ribosome recycling factor  36.2 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0913009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  35.8 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  32.2 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1250  ribosome recycling factor  35.63 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  33.92 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3273  ribosome recycling factor  31.52 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  31.79 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  33.15 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2545  ribosome recycling factor  37.2 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  33.92 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  36.99 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  36.26 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  33.52 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  34.91 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  33.15 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  34.08 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  31.72 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  35.33 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  33.33 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  32.61 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  35.48 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  33.88 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1318  ribosome recycling factor  35.11 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0899133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  33.92 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  33.73 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  33.73 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  33.73 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  33.14 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  32.42 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  31.69 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  30.65 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  34.24 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  33.92 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  33.73 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  32.75 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  33.33 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  33.92 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  33.73 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  34.24 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  31.07 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  32.16 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  30.65 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  34.5 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  32.16 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  34.5 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  32.61 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  33.33 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  31.52 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  32.78 
 
 		 185 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>