More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0048 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0048  ribosome recycling factor  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0913009  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  41.21 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  40.45 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1318  ribosome recycling factor  40.66 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0899133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  41.57 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl555  ribosome recycling factor  40.11 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.862763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  40 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  41.04 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  38.89 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  36.87 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  38.33 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  37.57 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  38.55 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  41.04 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  38.46 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  39.31 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  39.33 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  39.11 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  37.29 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  41.57 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  38.33 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  38.33 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  37.57 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  38.33 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  36.16 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  39.44 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  37.14 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  37.99 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  38.33 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  36.67 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  37.64 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  37.64 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  40.46 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  40.46 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  37.64 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  36.26 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4152  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0904163  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  37.29 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  38.76 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  36.11 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 185 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  39.16 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  37.08 
 
 		 185 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  37.85 
 
 		 186 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  36.87 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  36.78 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  36.16 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  35.96 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  37.93 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2061  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.804702  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  38.76 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  36.99 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  36.67 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  35.59 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  36.11 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  42.41 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  36.16 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  36.11 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  36.78 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  39.89 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  39.33 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  34.81 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  35.23 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  35 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1250  ribosome recycling factor  36.72 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  35.59 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  38.64 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  38.33 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  37.93 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  37.78 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  35.36 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  37.85 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  36.93 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  36.21 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  37.22 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>