More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1866 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1866  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374926 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 223 aa  214  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 219 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 219 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  45.45 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 221 aa  188  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 232 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  49.54 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.27 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  49.09 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  50.68 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  50.45 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1465  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  47.2 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.66 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.62 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.66 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.46 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  45.21 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.69 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.3 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.21 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  45.21 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.21 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  46.73 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.21 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  40.09 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3148  two component response regulator  49.76 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.174373  hitchhiker  0.000575412 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  40.09 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.66 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.15 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.44 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.44 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.44 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.44 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.44 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.16 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3990  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.300119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.38 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  44.86 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>