More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1164 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1164  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 		 158 aa  330  6e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000978819  hitchhiker  1.39991e-23 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  37.84 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  38.16 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.31 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  38.31 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0050  phosphotyrosine protein phosphatase, low molecular weight  38.16 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00169235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.26 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  38.26 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.26 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.26 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.26 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.26 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.66 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  33.12 
 
 		 186 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1912  protein-tyrosine phosphatase  37.09 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  37.24 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32 
 
 		 151 aa  87.4  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  32.26 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  35.95 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  37.74 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  36.13 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  28.66 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  28.85 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  28.57 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.87 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  31.61 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  31.61 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  30.97 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  29.22 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  30.26 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  27.92 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  34.09 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  32.47 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  29.33 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  29.22 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.29 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  29.22 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  28.93 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.58 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  30.32 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  32.1 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4051  protein tyrosine phosphatase  28.93 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00946919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  30.26 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  30.25 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  30.32 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  31.48 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  30.38 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  29.87 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  30.19 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  31.82 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  32.41 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  31.61 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  32.82 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  28.03 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  33.76 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  30.19 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  28.12 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  28.29 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  27.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  29.87 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  29.68 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  29.49 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.88 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  27.92 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.46 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  30.53 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>