243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1298 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1298  condensin subunit ScpA  100 
 
 
225 aa  456  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  41.06 
 
 
263 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  40.09 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  40.09 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  39.64 
 
 
247 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  39.64 
 
 
247 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  39.64 
 
 
247 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  39.64 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  39.64 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  39.64 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  39.64 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  38.84 
 
 
254 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  38.53 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  37.39 
 
 
248 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  38.03 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  37.44 
 
 
249 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.62 
 
 
272 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  34.56 
 
 
254 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.7 
 
 
262 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.43 
 
 
275 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.87 
 
 
262 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.78 
 
 
262 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.26 
 
 
251 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  35.94 
 
 
262 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 
267 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.8 
 
 
262 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  35.02 
 
 
262 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  35.48 
 
 
262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.87 
 
 
303 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.13 
 
 
281 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  35.48 
 
 
262 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.7 
 
 
287 aa  101  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.96 
 
 
295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.48 
 
 
302 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  31.53 
 
 
283 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  33.48 
 
 
302 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.96 
 
 
284 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  30.91 
 
 
272 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.88 
 
 
290 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.51 
 
 
290 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.88 
 
 
290 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  32.41 
 
 
245 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.1 
 
 
262 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.88 
 
 
290 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  34.4 
 
 
286 aa  98.6  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.42 
 
 
261 aa  98.6  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.51 
 
 
281 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.1 
 
 
262 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.18 
 
 
273 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.1 
 
 
262 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.4 
 
 
286 aa  98.6  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  33.33 
 
 
276 aa  98.2  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.42 
 
 
290 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  33.48 
 
 
293 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.96 
 
 
291 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.19 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.7 
 
 
285 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  33.48 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.28 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.56 
 
 
262 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  30.45 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  30.91 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  32.42 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.03 
 
 
297 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  32.42 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  33.03 
 
 
293 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  31.96 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.64 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.58 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  33.49 
 
 
283 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  31.96 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  32.58 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  31.96 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  31.96 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.49 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  31.96 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  31.96 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  31.96 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  31.96 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.47 
 
 
248 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.42 
 
 
290 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.42 
 
 
290 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.11 
 
 
276 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.48 
 
 
293 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.64 
 
 
262 aa  94.7  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
283 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  32.43 
 
 
279 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.58 
 
 
293 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.87 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  31.65 
 
 
275 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  30.36 
 
 
271 aa  92.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  32.31 
 
 
284 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  29.65 
 
 
248 aa  91.7  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  28.64 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 
248 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.45 
 
 
273 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.8 
 
 
303 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  31.75 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.56 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  31.65 
 
 
296 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>