More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1932 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
321 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  69.55 
 
 
325 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.81 
 
 
310 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.342776  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.85 
 
 
304 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
313 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
318 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.45 
 
 
315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.133391 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6476  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  38.29 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.882657  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.94 
 
 
316 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
355 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
333 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
335 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.51 
 
 
313 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
313 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
315 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
320 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742019  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
315 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
315 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
315 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
313 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  33.04 
 
 
339 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  34.95 
 
 
313 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
314 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
320 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
318 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1011  peptide ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 
317 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0953  peptide ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 
317 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
314 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.06 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
313 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
313 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
321 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
322 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
322 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
322 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
320 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
305 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.82 
 
 
313 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
316 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
311 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
313 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
341 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673833  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
313 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.55 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
334 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
305 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
340 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.284622  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  34.5 
 
 
313 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5089  branched-chain amino acid ABC transporter membrane protein  35.69 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242511  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
314 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.79 
 
 
308 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
334 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
313 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
313 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
315 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.29 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
315 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  35.54 
 
 
335 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
304 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
335 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
314 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  31.11 
 
 
315 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  31.41 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  34.64 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  normal  0.480947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
320 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.24 
 
 
335 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
335 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
313 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.54 
 
 
307 aa  179  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
336 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
306 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  33.12 
 
 
318 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
326 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
305 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.52 
 
 
306 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
306 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  34.52 
 
 
306 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
334 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.52 
 
 
306 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
306 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.52 
 
 
306 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.52 
 
 
306 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 
335 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>