87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1178 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 142 aa  275  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  51.43 
 
 		 157 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  41.01 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  45.26 
 
 		 181 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  44.12 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  37.14 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  42.14 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  43.54 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  40.88 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  43.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  43.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  43.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  45 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  38.41 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  41.84 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  41.18 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  31.82 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  37.12 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  40 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  36.05 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  39.31 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  42.15 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  34.75 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  47.14 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  20.44 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  38.62 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.5 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  38.62 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  25.17 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  31.9 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  36.96 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  25.35 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.86 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  26.57 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  40.71 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  33.04 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  27.66 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.58 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  23.24 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  33.04 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.86 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.58 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1131  hypothetical protein  21.17 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  24.65 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  24.65 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  24.65 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.37 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  24.65 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  41.98 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  30.83 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  39.29 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  29.29 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  26.39 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.38 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  28.78 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  23.61 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  29.05 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  28.38 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0928  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  34.51 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  22.92 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0931  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  22.38 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  22.38 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  29.01 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  24.48 
 
 		 153 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  28.38 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  25.35 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  29.1 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  39.62 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  30.3 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1862  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0801977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>