64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2220 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  298  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  35.1 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  37.68 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  32.64 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  36.22 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  30 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  29.85 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  30.67 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  33.86 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  33.86 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  30.41 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  33.07 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  33.07 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  34.44 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  32.37 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  33.86 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  28.95 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  31.76 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  31.43 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  34.29 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  26.97 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  29.29 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  27.03 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  32.14 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  34.87 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  30.52 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  32.86 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  34.65 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  34.65 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  34.65 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  34.65 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  31.43 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  30.43 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  31.43 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  31.43 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  31.43 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  29.53 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  29.87 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  28.08 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  33.1 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  28.8 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  25.66 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  26.49 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  31.52 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.71 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  27.66 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  30.22 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  30.37 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  30.5 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  30.71 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  32.48 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  30.61 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  35 
 
 
143 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  29.49 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  34.09 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  28.1 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  27.93 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  30.71 
 
 
148 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>