40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4507 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  299  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  85.81 
 
 		 157 aa  258  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  77.78 
 
 		 156 aa  246  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  78.95 
 
 		 154 aa  244  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  76 
 
 		 159 aa  243  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  77.63 
 
 		 156 aa  239  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  77.63 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  77.63 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  71.33 
 
 		 156 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  71.33 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  70.67 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  70.67 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  71.52 
 
 		 153 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  74.32 
 
 		 159 aa  227  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  72.79 
 
 		 155 aa  226  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  65.13 
 
 		 153 aa  217  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  35.57 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  27.03 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  26.17 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  28.66 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  29.73 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  29.8 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  29.58 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  26.35 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  26.35 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  26.53 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  26.06 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  32.45 
 
 		 464 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  27.03 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  32.45 
 
 		 462 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  29.71 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  29.71 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  27.59 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  28.86 
 
 		 481 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.47 
 
 		 584 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  26.03 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  27.59 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>