55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2090 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 143 aa  269  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  46.48 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  43.38 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  45.65 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  44.12 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  44.12 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  44.12 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  44.2 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  39.57 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  45.74 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  44.93 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  42.55 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  42.98 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  44.17 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  41.73 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  35.04 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  41.91 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  38.41 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  39.71 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  37.32 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  36.76 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  39.18 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  34.74 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  37.86 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  41.55 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  43.3 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  31.93 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  27.41 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  40.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  31.16 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.5 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  35 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.79 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  39.13 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  35.42 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  35.53 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  28.26 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  31.21 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  30.68 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  34.35 
 
 		 458 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  32.79 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  35.66 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  36.08 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.58 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  32.64 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  34.78 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  27.21 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  35.59 
 
 		 151 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  29.5 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  34.06 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  30.07 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  26.43 
 
 		 136 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>