97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004151 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  100 
 
 
153 aa  306  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  72.55 
 
 
153 aa  242  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  62.33 
 
 
149 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  56 
 
 
150 aa  148  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  42 
 
 
149 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  39.58 
 
 
151 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  40.43 
 
 
151 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  40.71 
 
 
151 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  38.62 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  38.19 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  39.37 
 
 
152 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  39.37 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  38.93 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  38.17 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  38.17 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  38.17 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  38.17 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  38.17 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  37.8 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  34.64 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  36.22 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  34.75 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  34.75 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  34.75 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  37.33 
 
 
147 aa  87  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  34.01 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  32.12 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  29.37 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  38.19 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  38.73 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  36.11 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  34.9 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  36.11 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  36.49 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  32.35 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  37.32 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  29.29 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  36.76 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  36.22 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  36.22 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  36.22 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  36.22 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  34.43 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  33.79 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  27.74 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  33.79 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  36.05 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  33.33 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  31.91 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  35.71 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  28.19 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  31.25 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  29.92 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  32.64 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  27.08 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  26.56 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  24.83 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  29.29 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  27.01 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  28.17 
 
 
157 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  27.01 
 
 
145 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  27.14 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1879  hypothetical protein  26.06 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0165803  normal  0.0358717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  30.5 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  26.24 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  26.67 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  26.76 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  25.87 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  26.67 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  25.71 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  25.71 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25.71 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  25.53 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  25.53 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  26.43 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25.71 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  23.57 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  26.43 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  27.34 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  29.25 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  26.32 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  24.65 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  23.94 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  27.94 
 
 
455 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  25.33 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  25 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  29.69 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  27.35 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  24.48 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  24.48 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  24.48 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  23.74 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>