68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2052 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
157 aa  288  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  60.26 
 
 
152 aa  137  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  54.74 
 
 
181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  52.48 
 
 
142 aa  100  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  47.83 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  42.25 
 
 
154 aa  97.1  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  44.76 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  45.71 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  45.99 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  55.56 
 
 
160 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  45.77 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  44.2 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  51.59 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  43.57 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  48 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  45.93 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  44.29 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  43.36 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  41.61 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  42.25 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  42.25 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  42.25 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  34.26 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  39.84 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  41.38 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  39.57 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  31.94 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  32.33 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  42.27 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  41.13 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  41.84 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  42.65 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  40.85 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  38.89 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  40.74 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  35.46 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  32.86 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  41.01 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  32.62 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  31.43 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  25.53 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  27.14 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  33.09 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  28.19 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  35.45 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  38.04 
 
 
125 aa  47.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.17 
 
 
144 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  29.55 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  26.79 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  30.53 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1131  hypothetical protein  27.86 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  32.86 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  35.05 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  29.03 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  23.91 
 
 
429 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  32 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  32.67 
 
 
455 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  30.53 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  33.58 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  35.48 
 
 
453 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  32.63 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  35.63 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  32.82 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 
151 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>