94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2309 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  300  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  45.04 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  43.36 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  34.97 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  30.3 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  29.8 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  32.87 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  37.06 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  30.28 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  35.25 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  27.78 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  32.64 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  31.88 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  36.03 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  31.25 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  30.43 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  31.79 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  27.85 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  31.61 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.29 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  31.08 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  28.37 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  28.17 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  26.76 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  36.13 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  34.33 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  34.33 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  32.39 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  36.13 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  35.54 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  27.66 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  36.13 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  36.13 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  31.06 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  27.63 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  34.71 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  22.38 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  34.71 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  31.88 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  28.68 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  34.02 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  27.66 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  33.1 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  28.37 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  31.16 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  33.61 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  26.95 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  33.61 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  26.53 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  26.42 
 
 		 462 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  28.06 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  27.54 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  28.38 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  33.8 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  27.03 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  26.95 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  28.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  26.95 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  26.95 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  26.95 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  26.95 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  28.38 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  28.28 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1715  protein of unknown function DUF107  33.75 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  26.71 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  32.41 
 
 		 443 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  28.77 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  26.43 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  24.67 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  28.76 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  27.45 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  28.28 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  32.88 
 
 		 140 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  31.33 
 
 		 455 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  30.59 
 
 		 453 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  32.17 
 
 		 430 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  29.61 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  26.95 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  24.65 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1862  hypothetical protein  36.05 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0801977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  24.31 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0563  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.308854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2223  hypothetical protein  25.81 
 
 		 214 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>