68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  100 
 
 
143 aa  273  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  54.23 
 
 
143 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  48.23 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  47.45 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  46.43 
 
 
144 aa  103  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  42.14 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  42.14 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  42.14 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  39.57 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  36.88 
 
 
144 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  40.74 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  45.6 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  46.28 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  35.51 
 
 
143 aa  84.3  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  49.45 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  42.45 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  38.13 
 
 
153 aa  76.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  44.2 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  43.8 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  29.37 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  38.13 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  37.68 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.99 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  30.28 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  32.33 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  36.23 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  42.34 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  33.08 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  31.62 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  33.1 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  35.77 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  37.59 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  38.52 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  28.37 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  33.57 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  36.43 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  39.8 
 
 
152 aa  57.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  43.43 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  43.62 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  28.97 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  29.5 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
147 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
147 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  28.78 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  28.99 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  28.78 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  31.47 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1862  hypothetical protein  35.9 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0801977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.06 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  22.46 
 
 
137 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  28.99 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  28.28 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  27.59 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  25.44 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  25.44 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  25.44 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  31.69 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  33.82 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  26.35 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  35.56 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  28.99 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>