99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1099 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  297  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  94.04 
 
 		 151 aa  263  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  70.75 
 
 		 149 aa  197  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  70.55 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  64.47 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  62.42 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  62.42 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  62.42 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  60.4 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  60.4 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  60.4 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  61.22 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  60.4 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  60.4 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  60.4 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  59.06 
 
 		 152 aa  156  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  59.73 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  59.06 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  55.7 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  57.82 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  57.82 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  57.82 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  57.82 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  42.96 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  46.62 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  39.58 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  37.66 
 
 		 153 aa  106  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  40.85 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  38.51 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  40.88 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  46.98 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  38.51 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  40.27 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  38.85 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  36.6 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  38.36 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  38.36 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  34.19 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  35.46 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  37.58 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  39.13 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  39.19 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  36.17 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  38.69 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  34.29 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  35.43 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  37.33 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  38.24 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  35.57 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  36.81 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  35.77 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  33.07 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  34.43 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  37.23 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  36.23 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  35.42 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  28.47 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  30.61 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  29.25 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  27.86 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  27.94 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  25.83 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  27.89 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  27.21 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  26.53 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  27.46 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  27.89 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  37.29 
 
 		 455 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  28.17 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  26.47 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  26.47 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  26.47 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  26.47 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  26.47 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25.74 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25.74 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  31.47 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  26.81 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  24.65 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  26.81 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  23.65 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  30.57 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  25.17 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  30.71 
 
 		 464 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  28.47 
 
 		 154 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  28.42 
 
 		 458 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  26.57 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  31.53 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  28.86 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  29.93 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  38.03 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  25 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1879  hypothetical protein  28.87 
 
 		 160 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0165803  normal  0.0358717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>