76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3074 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 147 aa  283  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  56.03 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  61.7 
 
 		 144 aa  137  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  53.68 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  43.28 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  45.26 
 
 		 150 aa  100  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  40.29 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  43.06 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  40.71 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  42.03 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  39.16 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  37.59 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  45.08 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  42.65 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  40.58 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  43.38 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  39.72 
 
 		 149 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  39.86 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  37.06 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  40.98 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  34.56 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  40.34 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  40 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  38.73 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  35.48 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  38.46 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  41.3 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  35.38 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  38.41 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  31.69 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  36.22 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  27.97 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  33.07 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  33.07 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  33.07 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  33.07 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  33.07 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  30.08 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  34.62 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  34.17 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  36.17 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  36.17 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  36.17 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  36.17 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  28.57 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.37 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  30.43 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  28.77 
 
 		 140 aa  48.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  28.08 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  25.52 
 
 		 147 aa  48.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  30.15 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  30.88 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  30.88 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  30.88 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  30.88 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  30.15 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  30.88 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  30.88 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  30.15 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  31.39 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  30.88 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  29.86 
 
 		 455 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  31.62 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  24 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>