109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3306 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 153 aa  299  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  96.69 
 
 		 151 aa  287  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  64.24 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  57.89 
 
 		 152 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  54.97 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  48 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  47.33 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  47.33 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  48.37 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  43.92 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  46.98 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  46.62 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  45.75 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  38.73 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  45.64 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  43.42 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  46.62 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  43.17 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  48.55 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  45.33 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  39.44 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  36.55 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  41.86 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  40.85 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  35.43 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  35.43 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  38.19 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  42.62 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  36.81 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  42.25 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  37.32 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  37.32 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  37.32 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  39.74 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  39.44 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  35.26 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  35.85 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  35.07 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  35.07 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  35.07 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  35.07 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  35.07 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  34.33 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  35.07 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  36.64 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  34.59 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  34.59 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  31.21 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  31.58 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  35.11 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  30.52 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  35.88 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  35.88 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  35.88 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  35.88 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  28.99 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  30.87 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  30.2 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  30.2 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  30.87 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  27.52 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  28.97 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.25 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  29.37 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  26.17 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  30.56 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  26.9 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  26.39 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  26.76 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  27.34 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  24.83 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  24.83 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  24.83 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  30.5 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  28.38 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  21.68 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  26.95 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  27.03 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  26.95 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  28.48 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  27.66 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  27.66 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  26.17 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  27.03 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  27.59 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  25.69 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  24.82 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  27.66 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  26.24 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  29.41 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  27.54 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  24.82 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>