35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3072 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  313  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  74 
 
 		 157 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  70.51 
 
 		 156 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  73.33 
 
 		 155 aa  229  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  74.32 
 
 		 153 aa  227  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  71.62 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  71.62 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  71.62 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  67.95 
 
 		 156 aa  224  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  67.95 
 
 		 156 aa  224  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  67.95 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  70.95 
 
 		 156 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  71.62 
 
 		 154 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  70.95 
 
 		 153 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  66.04 
 
 		 159 aa  220  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  67.57 
 
 		 153 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  28.29 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  28 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  28.89 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  28.38 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  30.82 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  32.47 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  25.68 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  25.68 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  27.59 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  30.67 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  32.39 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  27.89 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  27.89 
 
 		 140 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 158 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  31.01 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  27.89 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>