34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0462 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  315  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  79.61 
 
 
157 aa  248  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  76 
 
 
153 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  72.37 
 
 
156 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  76 
 
 
156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  76 
 
 
156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  71.71 
 
 
156 aa  237  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  76.51 
 
 
156 aa  237  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  71.71 
 
 
156 aa  237  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  71.71 
 
 
156 aa  237  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  75.33 
 
 
156 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  74.67 
 
 
154 aa  234  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  71.05 
 
 
153 aa  230  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  67.76 
 
 
155 aa  224  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  66.04 
 
 
159 aa  220  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  65.1 
 
 
153 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  32.67 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  27.86 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  28.17 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  28.97 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  26.32 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  28.67 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  25.17 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  29.17 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  32.45 
 
 
464 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  29.53 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  26.32 
 
 
436 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  32.45 
 
 
462 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  23.97 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  24.66 
 
 
151 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  30.92 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  23.97 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  27.66 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  27.34 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>