79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1329 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  266  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  57.25 
 
 
152 aa  158  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  57.25 
 
 
140 aa  147  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  56.49 
 
 
140 aa  146  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  34.31 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  39.2 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.7 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  30.3 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  35.34 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  34.59 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  35.04 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  35.04 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  35.04 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0563  hypothetical protein  38.38 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.308854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  35.04 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  35.04 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  33.08 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  35.85 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  35.04 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  33.59 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  35.04 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  30.23 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  29.84 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  34.23 
 
 
153 aa  57.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  33.58 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  35.43 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  29.55 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  33.85 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.33 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  30.08 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  30.6 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  33.6 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  30.6 
 
 
181 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  33.82 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  28.89 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  32.58 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  25.19 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  28.45 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  33.71 
 
 
143 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  25.87 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  31.16 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  26.87 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.54 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  27.27 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  27.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  26.72 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  30.82 
 
 
462 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  28 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  26.21 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  28.06 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  26.12 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  25.38 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  25.19 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  27.08 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  28 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  26.28 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  26.67 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  29.93 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1862  hypothetical protein  32.89 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0801977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  25.56 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  29.93 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  24.44 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  29.93 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  25.19 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  27.21 
 
 
151 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  25.19 
 
 
145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  30.3 
 
 
160 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  25.93 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  27.01 
 
 
473 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  26.67 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  25.56 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  27.48 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  25.55 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  24.62 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>