58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0971 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
158 aa  304  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  52.98 
 
 
151 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  45.52 
 
 
154 aa  130  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  56.55 
 
 
152 aa  130  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  42.18 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  28.08 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  27.4 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  26.8 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  28.21 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  27.03 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  28.67 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  30.61 
 
 
460 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  26.35 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  32.85 
 
 
488 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  27.33 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  25.33 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  27.59 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  30.41 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  29.53 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  31.65 
 
 
181 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  25.97 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  24.67 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  24.67 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.05 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  24.67 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  26 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  28.78 
 
 
136 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  25.83 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  25.83 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  29.32 
 
 
437 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  26.95 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  30.37 
 
 
455 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  32.06 
 
 
455 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  26.71 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  28.77 
 
 
473 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  25.52 
 
 
142 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  25.17 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  26.88 
 
 
462 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  36 
 
 
464 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  22.37 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  27.15 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  29.94 
 
 
481 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  25.52 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  27.33 
 
 
453 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0358  hypothetical protein  26.23 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  26.53 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  30.87 
 
 
151 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  26.85 
 
 
443 aa  41.6  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  25.17 
 
 
510 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  25.35 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  33.03 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  25.35 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  25.35 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  31.13 
 
 
464 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1115  hypothetical protein  26.79 
 
 
126 aa  40.4  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>