69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1862 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  285  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0801977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  28.37 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  31.15 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  32.88 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  30.6 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  30.33 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  30.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  30.94 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.59 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  29.85 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  29.85 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  30.88 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  29.85 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  29.85 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  29.85 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  25.36 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  28.35 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  33.02 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.2 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  33.04 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  26.28 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  32.46 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  24.64 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  31.88 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  35.48 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.98 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  27.01 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  33.61 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  33.05 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  30.71 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  33.9 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  33.57 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  29.37 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  43.55 
 
 		 394 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  32.39 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  31.65 
 
 		 433 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  26.76 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  33.9 
 
 		 429 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  34.51 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  30.38 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  37.7 
 
 		 423 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  35.38 
 
 		 438 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  32 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  30.95 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  32.26 
 
 		 443 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  25.85 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  28.72 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  34.07 
 
 		 488 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  28.07 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  30.28 
 
 		 434 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  31.65 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  29.31 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  23.74 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  37.1 
 
 		 447 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  27.61 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  28.35 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  27.97 
 
 		 430 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  33.9 
 
 		 388 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  25.17 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  26.88 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0012  protein of unknown function DUF107  32.86 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  34.67 
 
 		 160 aa  40  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>