21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0012 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0012  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 124 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0697  hypothetical protein  57.73 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682497 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  47.37 
 
 		 454 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  45.33 
 
 		 427 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  35.71 
 
 		 421 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  38.55 
 
 		 428 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  35.96 
 
 		 430 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  32.94 
 
 		 437 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  40 
 
 		 439 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  31.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  42.86 
 
 		 394 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  33.98 
 
 		 462 aa  43.5  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  34.18 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  28.26 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  34.38 
 
 		 423 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  45.65 
 
 		 429 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  30.11 
 
 		 433 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  42.86 
 
 		 451 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  40  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  38.1 
 
 		 437 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>