15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0697 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0697  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  247  4e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682497 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0012  protein of unknown function DUF107  57.73 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  38.38 
 
 
454 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  38.64 
 
 
421 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  40.24 
 
 
428 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  29.31 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  27.91 
 
 
443 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  35.96 
 
 
429 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  43.08 
 
 
427 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  27.83 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  38.89 
 
 
394 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  28.7 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  30.68 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  32.58 
 
 
430 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0358  hypothetical protein  30.93 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>