29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1630 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  27.61 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  28.99 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  28.99 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  28.47 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  30.43 
 
 
150 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0563  hypothetical protein  32.14 
 
 
156 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.308854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  28.24 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.5 
 
 
140 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  28.78 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  22.38 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  26.21 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  24.79 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  28.24 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  27.56 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  24.44 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  27.66 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  29.71 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  25.66 
 
 
150 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  28.93 
 
 
154 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  21.09 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  27.48 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  26.03 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  22.92 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  26.56 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  31.03 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  24.26 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  25.18 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  27.66 
 
 
144 aa  40  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>