67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3019 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  327  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  89.74 
 
 		 156 aa  243  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  47.1 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  49.62 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  45.07 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  45.07 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  45.07 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  45.07 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  42.45 
 
 		 144 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  43.26 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  34.21 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  40.43 
 
 		 140 aa  87.8  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  49.18 
 
 		 144 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  39.72 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  42.55 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  42.14 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  37.23 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  42.14 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  39.86 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  42.45 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  38.24 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  43.57 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  40.44 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.68 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  38.41 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  33.85 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  38.69 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  39.72 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.96 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  40.58 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  41.84 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  35.09 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  35.21 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  37.86 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  37.84 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  29.93 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  39.61 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  39.69 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  25.34 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  27.54 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  30.37 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  29.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  30.08 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.08 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.08 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  29.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  24.49 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  24.49 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  29.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  29.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  27.21 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  29.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  29.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  33.11 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  23.13 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  30.6 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  38.62 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.54 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  30.85 
 
 		 458 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  25.49 
 
 		 158 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  28.36 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  33.63 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  26.39 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>