40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0463 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  85.81 
 
 
153 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  79.61 
 
 
159 aa  248  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  74.34 
 
 
153 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  78.38 
 
 
156 aa  233  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  77.7 
 
 
156 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  74.52 
 
 
156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  77.7 
 
 
156 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  70.78 
 
 
156 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  70.78 
 
 
156 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  74 
 
 
159 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  70.78 
 
 
156 aa  230  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  69.23 
 
 
156 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  75.68 
 
 
154 aa  226  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  67.76 
 
 
155 aa  222  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  68.63 
 
 
153 aa  219  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
144 aa  57.4  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  29.45 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.03 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  29.61 
 
 
436 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  28.45 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  32.19 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  28.38 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  32.62 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  27.34 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  31.34 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  27.89 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  26.71 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  27.63 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  31.34 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  28.17 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  23.97 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  23.97 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  28.86 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  25.35 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  24.83 
 
 
490 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  27.33 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  27.97 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>