56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3188 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  78.17 
 
 
144 aa  223  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  78.69 
 
 
144 aa  173  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  69.23 
 
 
144 aa  169  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  42.55 
 
 
143 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  42.14 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  47.62 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  42.86 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  45.07 
 
 
167 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  42.55 
 
 
156 aa  90.5  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  42.65 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  44.12 
 
 
143 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  38.3 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  43.8 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  35.42 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  36.88 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  36.62 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  38.24 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  34.72 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  44.29 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  36.62 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  39.44 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  41.96 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  38.73 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  43.66 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  36.59 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  43.48 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  40.23 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  37.76 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  29.08 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  43.48 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  44.32 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  29.17 
 
 
141 aa  53.9  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  35.92 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  29.93 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  50 
 
 
154 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.45 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  32.84 
 
 
154 aa  50.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.86 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  25.87 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  27.07 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  26.32 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  26.32 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  28.99 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  28.99 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  27.34 
 
 
458 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  22.7 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  26.32 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  27.94 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  28.87 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  27.94 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  27.94 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  27.94 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>