42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0465 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
147 aa  294  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
147 aa  294  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  60.87 
 
 
143 aa  173  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  56.62 
 
 
143 aa  161  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  54.68 
 
 
154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  56.3 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.86 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  24.18 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  30.34 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  27.08 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  30.66 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  26.35 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.68 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  25.53 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  26.95 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  23.38 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  23.38 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  23.97 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  28.68 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  26.24 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  25.68 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  32.19 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  28.68 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  26.24 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  28.39 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  23.29 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  28.68 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  23.38 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  26.53 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  23.97 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  23.97 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  24.32 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  22.08 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  24.49 
 
 
167 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  24.48 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  27.14 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02751  hypothetical protein  34.62 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.465338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>