62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3420 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 143 aa  261  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  55 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  53.62 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  47.06 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  46.27 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  45.59 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  45.59 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  45.59 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  46.38 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  46.67 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  44.37 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  42.54 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  42.14 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  41.04 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  40.3 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  42.28 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  36.15 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  48 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  35.42 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  48.36 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  42.65 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  41.3 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  45.65 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  42.96 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  45.83 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  36.03 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  35.25 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  44.68 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  41.61 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  34.31 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  38.24 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  44.88 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  30.07 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  46.07 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  44.87 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  40 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  45.57 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  50 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  36.8 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  31.16 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  40.98 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  36.47 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  28.78 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  28.78 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  22.63 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  35.56 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.63 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  32.61 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  31.34 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  33.08 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  30.15 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  26.72 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  31.88 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0083  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0908948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0842  protein of unknown function DUF107  33.79 
 
 		 197 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  30.37 
 
 		 156 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>